| Соперники | 1 матч | 2 матч |
| Интер (Братислава,Словакия) - Литекс (Ловеч,Болгария) | 1:0 | 0:3 |
| Интер (Милан,Италия) - Брашов (Румыния) | 3:0 | 3:0 |
| Серветт (Швейцария) - Славия (Прага,Чехия) | 1:0 | 1:1 |
| Рода (Керкраде,Нидерланды) - Филькир (Рейкьявик,Исландия) | 3:0 | 3:1 |
| ЦСКА (Киев,Украина) - Црвена Звезда (Белград,Сербия) | 3:2 | 0:0 |
| Гленчберлиги (Турция) - Хальмстад (Швеция) | 1:1 | 0:1 |
| АЕК (Афины,Греция) - Хайберниан (Эдинбург,Шотландия) | 2:0 | 0:2(2:3 ДВ) |
| Олимпия (Любляна,Словения) - Брондбю (Брондбю,Дания) | 2:4 | 0:0 |
| Утрехт (Утрехт,Нидерланды) - Грацер (Австрия) | 3:0 | 3:3 |
| Слован (Либерец,Чехия) - Слован (Братислава,Словакия) | 2:0 | 0:1 |
| Копенгаген (Копенгаген,Дания) - Обилич (Сербия) | 2:0 | 2:2 |
| ЦСКА (София,Болгария) - Шахтёр (Донецк,Украина) | 3:0 | 1:2 |
| Стандарт (Льеж,Бельгия) - Страсбур (Страсбург,Франция) | 2:0 | 2:2 |
| БАТЭ (Борисов,Беларусь) - Милан (Милан,Италия) | 0:2 | 0:4 |
| Черноморец (Новороссийск,Россия) - Валенсия (Валенсия,Испания) | 0:1 | 0:5 |
| Астон Вилла (Бирмингем,Англия) - Вартекс (Вараждин,Хорватия) | 2:3 | 1:0 |
| Парма (Парма,Италия) - ХИК (Хельсинки,Финляндия) | 1:0 | 2:0 |
| Нова-Горица (Нова-Горица,Словения) - Осиек (Осиек,Хорватия) | 1:2 | 0:1 |
| Ипсвич (Ипсвич,Англия) - Торпедо (Москва,Россия) | 1:1 | 2:1 |
| Килмарнок (Килмарнок,Шотландия) - Викинг (Ставангер,Норвегия) | 1:1 | 0:2 |
| Аякс (Амстердам,Нидерланды) - Аполлон (Лимасол,Кипр) | 2:0 | 3:0 |
| Реал (Сарагоса,Испания) - Силькеборг (Дания) | 3:0 | 2:1 |
| Динамо (Бухарест,Румыния) - Грассхоппер (Цюрих,Швейцария) | 1:3 | 1:3 |
| Пршибрам (Пршибрам,Чехия) - Седан (Седан,Франция) | 4:0 | 1:3 |
| Труа (Труа,Франция) - Ружомберок (Словакия) | 6:1 | 0:1 |
| Легия (Варшава,Польша) - Эльфсборг (Бурос,Швеция) | 4:1 | 6:1 |
| Вестерло (Вестерло,Бельгия) - Герта (Берлин,Германия) | 0:2 | 0:1 |
| Челси (Лондон,Англия) - Левски (София,Болгария) | 3:0 | 2:0 |
| Карнтен (Австрия) - ПАОК (Салоники,Греция) | 0:0 | 0:4 |
| Динамо (Москва,Россия) - Биркиркара (Биркиркара,Мальта) | 1:0 | 0:0 |
| Днепр (Днепропетровск,Украина) - Фиорентина (Флоренция,Италия) | 0:0 | 1:2 |
| Санкт-Галлен (Санкт-Галлен,Швейцария) - Стяуа (Бухарест,Румыния) | 2:1 | 1:1 |
| Бордо (Бордо,Франция) - Дебрецен (Дебрецен,Венгрия) | 5:1 | 1:3 |
| Хапоэль (Тель-Авив,Израиль) - Газиантепспор (Газиантеп,Турция) | 1:0 | 1:1 |
| Хака (Валкеакоски,Финляндия) - Унион (Берлин,Германия) | 1:1 | 0:3 |
| Партизан (Белград,Сербия) - Рапид (Вена,Австрия) | 1:0 | 1:5 |
| Сельта (Виго,Испания) - Сигма (Оломоуц,Чехия) | 4:0 | 3:4 |
| Спортинг (Лиссабон,Португалия) - Мидтъюлланд (Хернинг,Дания) | 0:3 | 3:2 |
| Анжи (Махачкала,Россия) - Глазго Рейнджерс (Глазго,Шотландия) | | 0:1(НП) |
| Хайдук (Сплит,Хорватия) - Висла (Краков,Польша) | 2:2 | 0:1 |
| Пари Сен-Жермен (Париж,Франция) - Рапид (Бухарест,Румыния) | 0:0 | 0:0(1:0 ДВ) |
| Маритиму (Фуншал,Португалия) - Лидс (Лидс,Англия) | 1:0 | 0:3 |
| Олимпиакос (Никосия,Кипр) - Брюгге (Брюгге,Бельгия) | 2:2 | 1:7 |
| Одд Гренланн (Шиен,Норвегия) - Хельсингборг (Хельсингборг,Швеция) | 2:2 | 1:1 |
| Виктория (Жижков,Чехия) - Тироль (Инсбрук,Австрия) | 0:0 | 0:1 |
| Динамо (Загреб,Хорватия) - Маккаби (Тель-Авив,Израиль) | 2:2 | 1:1 |
| Полония (Варшава,Польша) - Твенте (Энсхеде,Нидерланды) | 1:2 | 0:2 |
| Матадор (Печов,Словакия) - Фрайбург (Фрайбург,Германия) | 0:0 | 1:2 |
