| Соперники | 1 матч | 2 матч |
| Суперфунд (Пашинг,Австрия) - Зенит (Санкт-Петербург,Россия) | 2:2 | 1:1 |
| Крылья Советов (Самара,Россия) - БАТЭ (Борисов,Беларусь) | 2:0 | 2:0 |
| Банантс (Ереван,Армения) - Днепр (Днепропетровск,Украина) | 2:4 | 0:4 |
| Сопрон (Венгрия) - Металлург (Донецк,Украина) | 0:3 | 1:2 |
| Легия (Варшава,Польша) - Цюрих (Цюрих,Швейцария) | 0:1 | 1:4 |
| Нистру (Молдова) - Грац (Австрия) | 0:2 | 0:1 |
| Грассхоппер (Цюрих,Швейцария) - Висла (Плоцк,Польша) | 1:0 | 2:3 |
| Жилина (Жилина,Словакия) - Аустрия (Вена,Австрия) | 1:2 | 2:2 |
| Грослин (Польша) - Банска Быстрица (Словакия) | 4:1 | 0:0 |
| МТЗ-РИПО (Минск,Беларусь) - Теплице (Теплице,Чехия) | 1:1 | 1:2 |
| Хальмстад (Швеция) - Линфилд (Белфаст,Северная Ирландия) | 1:1 | 4:2 |
| Копенгаген (Копенгаген,Дания) - Кармартен (Кармартен,Уэльс) | 2:0 | 2:0 |
| Мидтъюлланд (Хернинг,Дания) - Торсхавн (Торсхавн,Фареры) | 2:1 | 2:2 |
| Бранн (Берген,Норвегия) - Альянсси (Хельсинки,Финляндия) | 0:0 | 2:0 |
| Юргерденс (Стокгольм,Швеция) - Корк Сити (Ирландия) | 1:1 | 0:0 |
| Металлург (Лиепая,Латвия) - Генк (Бельгия) | 2:3 | 0:3 |
| Рил (Рил,Уэльс) - Викинг (Ставангер,Норвегия) | 0:1 | 1:2 |
| Мюллюкоскен Палло-47 (Коувола,Финляндия) - Данди Юнайтед (Данди,Шотландия) | 0:0 | 2:2 |
| Эсбьерг (Эсбьерг,Дания) - Тромсё (Тромсё,Норвегия) | 0:1 | 1:0(3:2 Пн) |
| Майнц (Майнц,Германия) - Кефлавик (Исландия) | 2:0 | 2:0 |
| Интер (Запрешич,Хорватия) - Црвена Звезда (Белград,Сербия) | 1:3 | 0:4 |
| Публикум (Словения) - Левски (София,Болгария) | 1:0 | 0:3 |
| Динамо (Бухарест,Румыния) - Омония (Никосия,Кипр) | 3:1 | 1:2 |
| Вадуц (Лихтенштейн) - Бешикташ (Стамбул,Турция) | 0:1 | 1:5 |
| АПОЭЛ (Никосия,Кипр) - Маккаби (Тель-Авив,Израиль) | 1:0 | 0:1(2:2 ДВ) |
| Рапид (Бухарест,Румыния) - Вардар (Скопье,Северная Македония) | 3:0 | 1:1 |
| Литекс (Ловеч,Болгария) - Риекка (Риека,Хорватия) | 1:0 | 1:2 |
| Зета (Сербия) - Широкий берег (Босния и Герцеговина) | 0:1 | 2:4 |
| Белград (Белград,Сербия) - Локомотив (Пловдив,Болгария) | 2:1 | 0:1 |
| Милано (Куманово,Северная Македония) - Маккаби (Петтах-Тиква,Израиль) | 0:5 | 0:6 |
| Ашдод (Израиль) - Домжале (Домжале,Словения) | 2:2 | 1:1 |
