| Соперники | 1 матч | 2 матч |
| Крылья Советов (Самара,Россия) - АЗ (Алкмар,Нидерланды) | 5:3 | 1:3 |
| Монако (Монако,Франция) - Виллем II (Тилбург,Нидерланды) | 2:0 | 3:1 |
| Баник (Острава,Чехия) - Херенвен (Херенвен,Нидерланды) | 2:0 | 0:5 |
| Црвена Звезда (Белград,Сербия) - Спортинг (Брага,Португалия) | 0:0 | 1:1 |
| Хальмстад (Швеция) - Спортинг (Лиссабон,Португалия) | 1:2 | 2:1(2:3 ДВ) |
| Витория (Гимарайнш,Португалия) - Висла (Краков,Польша) | 3:0 | 1:0 |
| Бранн (Берген,Норвегия) - Локомотив (Москва,Россия) | 1:2 | 2:3 |
| Зенит (Санкт-Петербург,Россия) - АЕК (Афины,Греция) | 0:0 | 1:0 |
| ЦСКА (Москва,Россия) - Мидтъюлланд (Хернинг,Дания) | 3:1 | 3:1 |
| Шахтёр (Донецк,Украина) - Дебрецен (Дебрецен,Венгрия) | 4:1 | 2:0 |
| Хайберниан (Эдинбург,Шотландия) - Днепр (Днепропетровск,Украина) | 0:0 | 1:5 |
| ПАОК (Салоники,Греция) - Металлург (Донецк,Украина) | 1:1 | 2:2 |
| Рома (Рим,Италия) - Арис (Салоники,Греция) | 5:1 | 0:0 |
| Теплице (Теплице,Чехия) - Эспаньол (Барселона,Испания) | 1:1 | 0:2 |
| Осер (Осер,Франция) - Левски (София,Болгария) | 2:1 | 0:1 |
| Динамо (Бухарест,Румыния) - Эвертон (Ливерпуль,Англия) | 5:1 | 0:1 |
| Бешикташ (Стамбул,Турция) - Мальмё (Мальмё,Швеция) | 0:1 | 4:1 |
| Славия (Прага,Чехия) - Корк Сити (Ирландия) | 2:0 | 2:1 |
| Палермо (Палермо,Италия) - Анортосис (Ларнака,Кипр) | 2:1 | 4:0 |
| Брондбю (Брондбю,Дания) - Цюрих (Цюрих,Швейцария) | 2:0 | 1:2 |
| Ренн (Ренн,Франция) - Атлетико Осасуна (Памплона,Испания) | 3:1 | 0:0 |
| Тромсё (Тромсё,Норвегия) - Галатасарай (Стамбул,Турция) | 1:0 | 1:1 |
| Севилья (Севилья,Испания) - Майнц (Майнц,Германия) | 0:0 | 2:0 |
| Базель (Базель,Швейцария) - Широкий берег (Босния и Герцеговина) | 5:0 | 1:0 |
| Гамбург (Гамбург,Германия) - Копенгаген (Копенгаген,Дания) | 1:1 | 1:0 |
| АПОЭЛ (Никосия,Кипр) - Герта (Берлин,Германия) | 0:1 | 1:3 |
| Фейеноорд (Роттердам,Нидерланды) - Рапид (Бухарест,Румыния) | 1:1 | 0:1 |
| Маккаби (Петтах-Тиква,Израиль) - Партизан (Белград,Сербия) | 0:2 | 5:2 |
| Байер (Леверкузен,Германия) - ЦСКА (София,Болгария) | 0:1 | 0:1 |
| Литекс (Ловеч,Болгария) - Генк (Бельгия) | 2:2 | 1:0 |
| Грац (Австрия) - Страсбур (Страсбург,Франция) | 0:2 | 0:5 |
| Болтон Уандерерз (Болтон,Англия) - Локомотив (Пловдив,Болгария) | 2:1 | 2:1 |
| Валеренга (Осло,Норвегия) - Стяуа (Бухарест,Румыния) | 0:3 | 1:3 |
| Мидлсбро (Мидлсбро,Англия) - Ксанти (Греция) | 2:0 | 0:0 |
| Викинг (Ставангер,Норвегия) - Аустрия (Вена,Австрия) | 1:0 | 1:2 |
| Грассхоппер (Цюрих,Швейцария) - Мюллюкоскен Палло-47 (Коувола,Финляндия) | 1:1 | 3:0 |
| Витория (Сетубал,Португалия) - Сампдория (Генуя,Италия) | 1:1 | 0:1 |
| Штутгарт (Штутгарт,Германия) - Домжале (Домжале,Словения) | 2:0 | 0:1 |
| Ланс (Ланс,Франция) - Грослин (Польша) | 1:1 | 4:2 |
| Жерминаль (Бельгия) - Олимпик (Марсель,Франция) | 0:0 | 0:0(4:1 Пн) |
