| Соперники | 1 матч | 2 матч |
| Рубин (Казань,Россия) - Парма (Парма,Италия) | 0:1 | 0:1 |
| Левадия (Таллин,Эстония) - Ньюкасл (Ньюкасл-апон-Тайн,Англия) | 0:1 | 1:2 |
| Бешикташ (Стамбул,Турция) - ЦСКА (София,Болгария) | 2:0 | 2:2(ДВ) |
| Черноморец (Одесса,Украина) - Хапоэль (Тель-Авив,Израиль) | 0:1 | 1:3 |
| Молде (Норвегия) - Глазго Рейнджерс (Глазго,Шотландия) | 0:0 | 0:2 |
| Базель (Базель,Швейцария) - Работнички (Скопье,Северная Македония) | 6:2 | 1:0 |
| Висла (Краков,Польша) - Ираклис (Греция) | 0:1 | 2:0(ДВ) |
| Герта (Берлин,Германия) - ОБ (Оденсе,Дания) | 2:2 | 0:1 |
| Этвидабергс (Швеция) - Грассхоппер (Цюрих,Швейцария) | 0:3 | 0:5 |
| Старт (Норвегия) - Аякс (Амстердам,Нидерланды) | 2:5 | 0:4 |
| Олимпик (Марсель,Франция) - Млада-Болеслав (Млада-Болеслав,Чехия) | 1:0 | 2:4 |
| Этникос (Ахна,Кипр) - Ланс (Ланс,Франция) | 0:0 | 1:3 |
| АЗ (Алкмар,Нидерланды) - Кайсериспор (Турция) | 3:2 | 1:1 |
| Сион (Швейцария) - Байер (Леверкузен,Германия) | 0:0 | 1:3 |
| Атромитос-Халкидона (Греция) - Севилья (Севилья,Испания) | 1:2 | 0:4 |
| Локомотив (Москва,Россия) - Зюльте-Варегем (Бельгия) | 2:1 | 0:2 |
| Витория (Сетубал,Португалия) - Херенвен (Херенвен,Нидерланды) | 0:3 | 0:0 |
| Партизан (Белград,Сербия) - Гронинген (Гронинген,Нидерланды) | 4:2 | 0:1 |
| Спортинг (Брага,Португалия) - Кьево (Верона,Италия) | 2:0 | 1:2(ДВ) |
| Панатинаикос (Афины,Греция) - Металлург (Запорожье,Украина) | 1:1 | 1:0 |
| Стандарт (Льеж,Бельгия) - Сельта (Виго,Испания) | 0:1 | 0:3 |
| Петржалка (Братислава,Словакия) - Эспаньол (Барселона,Испания) | 2:2 | 1:3 |
| Слован (Либерец,Чехия) - Црвена Звезда (Белград,Сербия) | 2:0 | 2:1 |
| Ксанти (Греция) - Динамо (Бухарест,Румыния) | 3:4 | 1:4 |
| Славия (Прага,Чехия) - Тоттенхэм (Лондон,Англия) | 0:1 | 0:1 |
| Айнтрахт (Франкфурт,Германия) - Брондбю (Брондбю,Дания) | 4:0 | 2:2 |
| Хартс (Эдинбург,Шотландия) - Спарта (Прага,Чехия) | 0:2 | 0:0 |
| Трабзонспор (Трабзон,Турция) - Атлетико Осасуна (Памплона,Испания) | 2:2 | 0:0 |
| Динамо (Загреб,Хорватия) - Осер (Осер,Франция) | 1:2 | 1:3 |
| Вест Хэм (Лондон,Англия) - Палермо (Палермо,Италия) | 0:1 | 0:3 |
| Ружомберок (Словакия) - Брюгге (Брюгге,Бельгия) | 0:1 | 1:1 |
| Рапид (Бухарест,Румыния) - Насьонал де Мадейра (Фуншал,Португалия) | 1:0 | 2:1(ДВ) |
| Маккаби (Хайфа,Израиль) - Литекс (Ловеч,Болгария) | 1:1 | 3:1 |
| Ред Булл (Зальцбург,Австрия) - Блэкберн Роверс (Блэкберн,Англия) | 2:2 | 0:2 |
| Легия (Варшава,Польша) - Аустрия (Вена,Австрия) | 1:1 | 0:1 |
| Шальке (Гельзенкирхен,Германия) - Нанси (Нанси,Франция) | 1:0 | 1:3 |
| Фенербахче (Стамбул,Турция) - Раннерс (Раннерс,Дания) | 2:1 | 3:0 |
| Дэрри Сити (Дэрри Сити,Северная Ирландия) - Пари Сен-Жермен (Париж,Франция) | 0:0 | 0:2 |
| Ливорно (Ливорно,Италия) - Суперфунд (Пашинг,Австрия) | 2:0 | 1:0 |
| Локомотив (София,Болгария) - Фейеноорд (Роттердам,Нидерланды) | 2:2 | 0:0 |
