| Соперники | 1 матч | 2 матч |
| Войводина (Нови-Сад,Сербия) - Аустрия (Вена,Австрия) | 1:1 | 2:4 |
| Тромсё (Тромсё,Норвегия) - Славен Белупо (Копривница,Хорватия) | 2:1 | 2:0 |
| Сент-Патрикс Атлетик (Дублин,Ирландия) - Крылья Советов (Самара,Россия) | 1:0 | 2:3 |
| Полония (Варшава,Польша) - НАК (Бреда,Нидерланды) | 0:1 | 1:3 |
| Маккаби (Нетания,Израиль) - Галатасарай (Стамбул,Турция) | 1:4 | 0:6 |
| Фредрикстад (Норвегия) - Лех (Познань,Польша) | 1:6 | 2:1 |
| Хонка (Эспоо,Финляндия) - Карабах (Агдам,Азербайджан) | 0:1 | 1:2 |
| Ветра (Вильнюс,Литва) - Фулхэм (Лондон,Англия) | 0:3 | 0:3 |
| ПСВ (Эйндховен,Нидерланды) - Черное Море (Варна,Болгария) | 1:0 | 1:0 |
| Металлург (Донецк,Украина) - Интерблок (Любляна,Словения) | 2:0 | 3:0 |
| Васлуй (Васлуй,Румыния) - Омония (Никосия,Кипр) | 2:0 | 1:1 |
| Стяуа (Бухарест,Румыния) - Мотеруэлл (Мотеруэлл,Шотландия) | 3:0 | 3:1 |
| Брюгге (Брюгге,Бельгия) - Лахти (Лахти,Финляндия) | 3:2 | 1:1 |
| Спортинг (Брага,Португалия) - Эльфсборг (Бурос,Швеция) | 1:2 | 0:2 |
| Славия (Источно-Сараево,Босния и Герцеговина) - Кошице (Кошице,Словакия) | 0:2 | 1:3 |
| Севойно (Севойно,Сербия) - Лилль (Лилль,Франция) | 0:2 | 0:2 |
| Петровац (Петровац,Черногория) - Штурм (Грац,Австрия) | 1:2 | 0:5 |
| Риекка (Риека,Хорватия) - Металлист (Харьков,Украина) | 1:2 | 0:2 |
| Рома (Рим,Италия) - Гент (Гент,Бельгия) | 3:1 | 7:1 |
| Атлетик (Бильбао,Испания) - Янг Бойз (Берн,Швейцария) | 0:1 | 2:1 |
| Динамо (Тбилиси,Грузия) - Црвена Звезда (Белград,Сербия) | 2:0 | 2:5 |
| КР Рейкьявик (Рейкьявик,Исландия) - Базель (Базель,Швейцария) | 2:2 | 1:3 |
| Хельсингборг (Хельсингборг,Швеция) - Сараево (Босния и Герцеговина) | 2:1 | 1:2(-:+ Пн) |
| Гетеборг (Гетеборг,Швеция) - Хапоэль (Тель-Авив,Израиль) | 1:3 | 1:1 |
| Брондбю (Брондбю,Дания) - Легия (Варшава,Польша) | 1:1 | 2:2 |
| Жилина (Жилина,Словакия) - Хайдук (Сплит,Хорватия) | 1:1 | 1:0 |
| Работнички (Скопье,Северная Македония) - ОБ (Оденсе,Дания) | 3:4 | 0:3 |
| Абердин (Абердин,Шотландия) - Сигма (Оломоуц,Чехия) | 1:5 | 0:3 |
| ЦСКА (София,Болгария) - Дэрри Сити (Дэрри Сити,Северная Ирландия) | 1:0 | 1:1 |
| Вадуц (Лихтенштейн) - Слован (Либерец,Чехия) | 0:1 | 0:2 |
| Валеренга (Осло,Норвегия) - ПАОК (Салоники,Греция) | 1:2 | 1:0 |
| Фенербахче (Стамбул,Турция) - Гонвед (Будапешт,Венгрия) | 5:1 | 1:1 |
| Раннерс (Раннерс,Дания) - Гамбург (Гамбург,Германия) | 0:4 | 1:0 |
| Бней Йехуда (Тель-Авив,Израиль) - Пасуш де Феррейра (Пасуш де Феррейра,Португалия) | 1:0 | 1:0 |
| Рапид (Вена,Австрия) - АПОП (Кинирас,Кипр) | 2:1 | 2:2 |
