| Соперники | 1 матч | 2 матч |
| Шахтeр (Солигорск,Беларусь) - Рид (Рид им Иннкрайс,Австрия) | 1:1 | 0:0 |
| Металурги (Рустави,Грузия) - Виктория (Пльзень,Чехия) | 1:3 | 0:2 |
| Войводина (Нови-Сад,Сербия) - Судува (Мариамполе,Литва) | 1:1 | 4:0 |
| Славен Белупо (Копривница,Хорватия) - Портадаун (Портадаун,Северная Ирландия) | 6:0 | 4:2 |
| Твенте (Энсхеде,Нидерланды) - Интер (Турку,Финляндия) | 1:1 | 5:0 |
| Широкий берег (Босния и Герцеговина) - Сент-Патрикс Атлетик (Дублин,Ирландия) | 1:1 | 1:2(ДВ) |
| Маккаби (Нетания,Израиль) - КуПС (Куопио,Финляндия) | 1:2 | 1:0 |
| Спартак (Трнава,Словакия) - Роверс (Слайго,Ирландия) | 3:1 | 1:1 |
| Ренова (Джепчиште,Северная Македония) - Гомель (Гомель,Беларусь) | 0:2 | 1:0 |
| Дифферданж (Дифферданж,Люксембург) - Гент (Гент,Бельгия) | 0:1 | 2:3 |
| Серветт (Швейцария) - Гандзасар (Капан,Армения) | 2:0 | 3:1 |
| Рух (Хожув,Польша) - Металург (Скопье,Северная Македония) | 3:1 | 3:0 |
| Тирана (Тирана,Албания) - Олесунн (Олесунн,Норвегия) | 1:1 | 0:5 |
| АПОЭЛ (Никосия,Кипр) - Сеница (Сеница,Словакия) | 2:0 | 1:0 |
| Анжи (Махачкала,Россия) - Гонвед (Будапешт,Венгрия) | 1:0 | 4:0 |
| Нафтан (Новополоцк,Беларусь) - Црвена Звезда (Белград,Сербия) | 3:4 | 3:3 |
| Левадия (Таллин,Эстония) - Анортосис (Ларнака,Кипр) | 1:3 | 0:3 |
| Янг Бойз (Берн,Швейцария) - Зимбру (Кишинев,Молдова) | 1:0 | 0:1(+:- Пн) |
| Хайдук (Сплит,Хорватия) - Сконто (Рига,Латвия) | 2:0 | 0:1 |
| Левски (София,Болгария) - Сараево (Босния и Герцеговина) | 1:0 | 1:3 |
| Рапид (Бухарест,Румыния) - Мюллюкоскен Палло-47 (Коувола,Финляндия) | 3:1 | 2:0 |
| Олимпия (Любляна,Словения) - Тромсё (Тромсё,Норвегия) | 0:0 | 0:1(ДВ) |
| АИК (Швеция) - Хафнафьордур (Хафнафьордур,Исландия) | 1:1 | 1:0 |
| Дачия (Кишинев,Молдова) - Эльфсборг (Бурос,Швеция) | 1:0 | 0:2 |
| Металлург (Лиепая,Латвия) - Легия (Варшава,Польша) | 2:2 | 1:5 |
| Млада-Болеслав (Млада-Болеслав,Чехия) - Тор (Акюрейри,Исландия) | 3:0 | 1:0 |
| Бней Йехуда (Тель-Авив,Израиль) - Ширак (Гюмри,Армения) | 2:0 | 1:0 |
| Ювяскюля (Ювяскюля,Финляндия) - Зета (Голубовци,Черногория) | 3:2 | 0:1 |
| Осиек (Осиек,Хорватия) - Кальмар (Кальмар,Швеция) | 1:3 | 0:3 |
| Русенборг (Норвегия) - Ордабасы (Шымкент,Казахстан) | 2:2 | 2:1 |
| Мура 05 (Мурска-Собота,Словения) - ЦСКА (София,Болгария) | 0:0 | 1:1 |
| Металлург (Донецк,Украина) - Челик (Никшич,Черногория) | 7:0 | 4:2 |
| Хазар (Азербайджан) - Лех (Познань,Польша) | 1:1 | 0:1 |
| Милсами (Оргеев,Молдова) - Актобе (Актобе,Казахстан) | 4:2 | 0:3 |
| Интер (Баку,Азербайджан) - Астерас (Триполи,Греция) | 1:1 | 1:1(-:+ Пн) |
| Орхус (Орхус,Дания) - Дила (Гори,Грузия) | 1:2 | 1:3 |
| Эскишехирспор (Эскишехир,Турция) - Сент-Джонстон (Перт,Шотландия) | 2:0 | 1:1 |
| Жальгирис (Вильнюс,Литва) - Адмира (Мария Энзердорф,Австрия) | 1:1 | 1:5 |
| Слован (Братислава,Словакия) - Видеотон (Секешфехервар,Венгрия) | 1:1 | 0:0 |
| Локомотив (Пловдив,Болгария) - Витесс (Арнем,Нидерланды) | 4:4 | 1:3 |
