| Соперники | 1 матч | 2 матч |
| Тун (Тун,Швейцария) - Спартак (Москва,Россия) | 2:3 | 1:2 |
| Спарта (Прага,Чехия) - Трабзонспор (Трабзон,Турция) | 2:2 | 1:2 |
| Дюделанж (Дюделанж,Люксембург) - Нымме Калью (Таллин,Эстония) | 3:1 | 1:0 |
| Арарат (Ереван,Армения) - Сабуртало (Тбилиси,Грузия) | 1:2 | 2:0 |
| Маккаби (Тель-Авив,Израиль) - Судува (Мариамполе,Литва) | 1:2 | 1:2 |
| Сараево (Босния и Герцеговина) - БАТЭ (Борисов,Беларусь) | 1:2 | 0:0 |
| Слован (Братислава,Словакия) - Дундалк (Ирландия) | 1:0 | 3:1 |
| Стяуа (Бухарест,Румыния) - Млада-Болеслав (Млада-Болеслав,Чехия) | 0:0 | 1:0 |
| Нефтчи (Баку,Азербайджан) - Бней Йехуда (Тель-Авив,Израиль) | 2:2 | 1:2 |
| ЦСКА (София,Болгария) - Заря (Луганск,Украина) | 1:1 | 0:1 |
| Мариуполь (Мариуполь,Украина) - АЗ (Алкмар,Нидерланды) | 0:0 | 0:4 |
| Астана (Астана,Казахстан) - Валетта (Валетта,Мальта) | 5:1 | 4:0 |
| Мальмё (Мальмё,Швеция) - Зриньски (Мостар,Босния и Герцеговина) | 3:0 | 0:1 |
| Лудогорец (Разград,Болгария) - Нью Сайнтс (Уэльс) | 5:0 | 4:0 |
| Сутьеска (Никшич,Черногория) - Линфилд (Белфаст,Северная Ирландия) | 1:2 | 2:3 |
| Брондбю (Брондбю,Дания) - Спортинг (Брага,Португалия) | 2:4 | 1:3 |
| Люцерн (Швейцария) - Эспаньол (Барселона,Испания) | 0:3 | 0:3 |
| Вентспилс (Вентспилс,Латвия) - Витория (Гимарайнш,Португалия) | 0:3 | 0:6 |
| Легия (Варшава,Польша) - Атромитос (Перистери,Греция) | 0:0 | 2:0 |
| Хёугесунн (Хёугесунн,Норвегия) - ПСВ (Эйндховен,Нидерланды) | 0:1 | 0:0 |
| Норрчёпинг (Норвегия) - Хапоэль (Беэр-Шева,Израиль) | 1:1 | 1:3 |
| Рига (Рига,Латвия) - ХИК (Хельсинки,Финляндия) | 1:1 | 2:2 |
| Партизан (Белград,Сербия) - Ени Малатьяспор (Малатья,Турция) | 3:1 | 0:1 |
| Торино (Турин,Италия) - Шахтeр (Солигорск,Беларусь) | 5:0 | 1:1 |
| Мидтъюлланд (Хернинг,Дания) - Глазго Рейнджерс (Глазго,Шотландия) | 2:4 | 1:3 |
| Университатя (Крайова,Румыния) - АЕК (Афины,Греция) | 0:2 | 1:1 |
| АЕК (Ларнака,Кипр) - Гент (Гент,Бельгия) | 1:1 | 0:3 |
| Шериф (Тирасполь,Молдова) - АИК (Швеция) | 1:2 | 1:1 |
| Риекка (Риека,Хорватия) - Абердин (Абердин,Шотландия) | 2:0 | 2:0 |
| Вадуц (Лихтенштейн) - Айнтрахт (Франкфурт,Германия) | 0:5 | 0:1 |
| Молде (Норвегия) - Арис (Салоники,Греция) | 3:0 | 1:3(ДВ) |
| Аустрия (Вена,Австрия) - Аполлон (Лимасол,Кипр) | 1:2 | 1:3 |
| Фейеноорд (Роттердам,Нидерланды) - Динамо (Тбилиси,Грузия) | 4:0 | 1:1 |
| Пюник (Ереван,Армения) - Вулверхемптон (Вулверхемптон,Англия) | 0:4 | 0:4 |
| Локомотив (Пловдив,Болгария) - Страсбур (Страсбург,Франция) | 0:1 | 0:1 |
| Антверпен (Антверпен,Бельгия) - Виктория (Пльзень,Чехия) | 1:0 | 1:2(ДВ) |
