| Дата | Матч | Счет | * |
| 26.11.2006 | Зенит (Санкт-Петербург) - Томь (Томск) | 0:0 | 1 |
| 18.11.2006 | Томь (Томск) - Москва (Москва) | 1:0 | 1 |
| 08.11.2006 | Томь (Томск) - Локомотив (Москва) | 3:1 | 1 |
| 04.11.2006 | Спартак (Москва) - Томь (Томск) | 3:1 | 1 |
| 29.10.2006 | Томь (Томск) - Спартак (Нальчик) | 1:0 | 1 |
| 25.10.2006 | Луч (Владивосток) - Томь (Томск) | 2:1 | 1 |
| 22.10.2006 | Томь (Томск) - Крылья Советов (Самара) | 2:1 | 1 |
| 15.10.2006 | Ростов (Ростов-на-Дону) - Томь (Томск) | 2:1 | 1 |
| 30.09.2006 | Томь (Томск) - Амкар (Пермь) | 1:3 | 1 |
| 24.09.2006 | Сатурн (Раменское) - Томь (Томск) | 2:1 | 1 |
| 17.09.2006 | Томь (Томск) - ЦСКА (Москва) | 0:1 | 1 |
| 10.09.2006 | Томь (Томск) - Шинник (Ярославль) | 3:1 | 1 |
| 27.08.2006 | Динамо (Москва) - Томь (Томск) | 2:1 | 1 |
| 20.08.2006 | Томь (Томск) - Торпедо (Москва) | 0:0 | 1 |
| 12.08.2006 | Томь (Томск) - Зенит (Санкт-Петербург) | 2:2 | 1 |
| 06.08.2006 | Москва (Москва) - Томь (Томск) | 0:0 | 1 |
| 30.07.2006 | Томь (Томск) - Рубин (Казань) | 4:0 | 1 |
| 22.07.2006 | Локомотив (Москва) - Томь (Томск) | 1:1 | 1 |
| 16.07.2006 | Томь (Томск) - Спартак (Москва) | 2:2 | 1 |
| 12.07.2006 | Спартак (Нальчик) - Томь (Томск) | 1:0 | 1 |
| 07.07.2006 | Рубин (Казань) - Томь (Томск) | 2:0 | 1 |
| 13.05.2006 | Томь (Томск) - Луч (Владивосток) | 2:1 | 1 |
| 06.05.2006 | Крылья Советов (Самара) - Томь (Томск) | 2:1 | 1 |
| 30.04.2006 | Томь (Томск) - Ростов (Ростов-на-Дону) | 3:1 | 1 |
| 22.04.2006 | Амкар (Пермь) - Томь (Томск) | 0:0 | 1 |
| 16.04.2006 | Томь (Томск) - Сатурн (Раменское) | 0:0 | 1 |
| 08.04.2006 | ЦСКА (Москва) - Томь (Томск) | 2:0 | 1 |
| 01.04.2006 | Шинник (Ярославль) - Томь (Томск) | 0:1 | 1 |
| 26.03.2006 | Томь (Томск) - Динамо (Москва) | 1:0 | 1 |
| 17.03.2006 | Торпедо (Москва) - Томь (Томск) | 1:2 | 1 |
